Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0M5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0M5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X0M5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X0M5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X0M5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087X0M5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087X0M5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X0M5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087X0M5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087X0M5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X0M5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087X0M5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087X0M5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms