Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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