Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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