Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNCAIPQ9Y6H5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNCAIPQ9Y6H5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNCAIPQ9Y6H5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms