Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNPO3Q9Y5L0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNPO3Q9Y5L0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNPO3Q9Y5L0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNPO3Q9Y5L0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms