Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFRA4Q9GZZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms