Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF1Q9BSM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF1Q9BSM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms