Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms