Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC7Q96M83 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC7Q96M83 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms