Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGF29Q96ES7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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