Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RABGGTAQ92696 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGGTAQ92696 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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