Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSMEM1Q8WWF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms