Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BEST4Q8NFU0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEST4Q8NFU0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms