Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTA2Q6UW10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms