Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms