Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1LQ5PSV4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms