Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms