Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC6LQ2NKX8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms