Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TRIP10Q15642 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TRIP10Q15642 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TRIP10Q15642 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TRIP10Q15642 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP10Q15642 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TRIP10Q15642 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP10Q15642 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms