Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRADDQ15628 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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