Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.265e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.395e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.415e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.545e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.745e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 33.81□□□□□ -1.85e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.825e-23■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 MED10-203ENST00000504058 648 ntTSL 217.87■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 419.96■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-213ENST00000472725 632 ntTSL 319.44■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 RUFY1-203ENST00000393448 2320 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 317.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)17.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 NAPA-209ENST00000594740 857 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 217.12■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 517.06■□□□□ 0.323e-13■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PCBP4-214ENST00000490063 510 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 216.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 216.02■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PCBP4-209ENST00000471358 559 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TTC7A-209ENST00000484061 3085 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PRPF31-206ENST00000447810 854 ntTSL 515.34■□□□□ 0.053e-13■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PRPF31-204ENST00000445124 886 ntTSL 515.34■□□□□ 0.053e-13■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 NAPA-216ENST00000597274 583 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-12■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TTC7A-205ENST00000440051 641 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TSTA3-206ENST00000527549 575 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 NAPA-211ENST00000595826 853 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PCBP4-211ENST00000483411 563 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PCBP4-204ENST00000461544 562 ntTSL 412.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 FLII-211ENST00000488932 838 ntTSL 312.29□□□□□ -0.444e-12■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TTC7A-211ENST00000491786 3615 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ZBTB17-204ENST00000444358 722 ntTSL 512.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 410.02□□□□□ -0.814e-12■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ATAD3B-202ENST00000378736 414 ntTSL 59.63□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 RAB11FIP5-206ENST00000493523 4008 ntTSL 29.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 GTF2H4-203ENST00000453897 598 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 PGD-210ENST00000498356 790 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-204ENST00000526667 832 ntTSL 517.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DESI2-204ENST00000484738 1126 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-213ENST00000533799 617 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-202ENST00000526250 737 ntTSL 513.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 CD2BP2-201ENST00000305596 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 TARBP2-214ENST00000550147 1855 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-209ENST00000548971 1493 ntTSL 520.31■□□□□ 0.849e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-212ENST00000549610 1116 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-204ENST00000546763 846 ntTSL 217.03■□□□□ 0.329e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-211ENST00000549572 1514 ntTSL 515.94■□□□□ 0.149e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-213ENST00000549679 1466 ntTSL 515.06■□□□□ 09e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-215ENST00000550407 1132 ntTSL 514.4□□□□□ -0.19e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-217ENST00000551741 992 ntTSL 212.97□□□□□ -0.339e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-216ENST00000551157 1008 ntTSL 312.46□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 44.4
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