Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMB3Q13751 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMB3Q13751 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms