Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SELENBP1Q13228 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SELENBP1Q13228 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SELENBP1Q13228 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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