Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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IFT88Q13099 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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IFT88Q13099 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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IFT88Q13099 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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IFT88Q13099 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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IFT88Q13099 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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IFT88Q13099 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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IFT88Q13099 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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IFT88Q13099 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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IFT88Q13099 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT88Q13099 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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