Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MDM2Q00987 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDM2Q00987 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms