Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEMP55040 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEMP55040 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEMP55040 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEMP55040 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEMP55040 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GEMP55040 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GEMP55040 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEMP55040 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEMP55040 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEMP55040 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEMP55040 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEMP55040 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEMP55040 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEMP55040 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms