Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA1P52294 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA1P52294 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms