Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARSP41250 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARSP41250 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARSP41250 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARSP41250 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARSP41250 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARSP41250 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARSP41250 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARSP41250 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARSP41250 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms