Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCAP37840 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCAP37840 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCAP37840 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCAP37840 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNCAP37840 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCAP37840 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms