Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDFT1P37268 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms