Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSP1P33241 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSP1P33241 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSP1P33241 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSP1P33241 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSP1P33241 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSP1P33241 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSP1P33241 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSP1P33241 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSP1P33241 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSP1P33241 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms