Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN3P26045 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms