Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms