Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DESP17661 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DESP17661 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DESP17661 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DESP17661 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DESP17661 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DESP17661 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms