Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms