Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C4AP0C0L4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C4AP0C0L4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4AP0C0L4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C4AP0C0L4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C4AP0C0L4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C4AP0C0L4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C4AP0C0L4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4AP0C0L4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms