Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFDP00746 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFDP00746 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFDP00746 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFDP00746 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFDP00746 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFDP00746 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFDP00746 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFDP00746 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFDP00746 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms