Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms