Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARPC1BO15143 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms