Protein–RNA interactions for Protein: A6NJY4

Putative transmembrane protein LOC100289255, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NJY4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NJY4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NJY4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NJY4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A6NJY4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A6NJY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NJY4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A6NJY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A6NJY4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A6NJY4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms