Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC162PA2VCL2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms