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| PTPRJ | Q12913 | FAM131B-202 | ENST00000409346 | 4295 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 13.32 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GSE1-202 | ENST00000393243 | 7140 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.32 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BDNF-208 | ENST00000418212 | 4125 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.32 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYB561-202 | ENST00000392975 | 3007 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.32 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RASGEF1B-201 | ENST00000264400 | 2277 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 13.32 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GPALPP1-202 | ENST00000361121 | 3410 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ECHDC1-209 | ENST00000454591 | 1515 nt | TSL 2 BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CACNA1F-202 | ENST00000376251 | 5813 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | NR1H3-217 | ENST00000467728 | 2731 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UBASH3A-202 | ENST00000319294 | 2504 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AREG-201 | ENST00000395748 | 1240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL096772.1-201 | ENST00000451135 | 781 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OR7E26P-201 | ENST00000502808 | 1006 nt | BASIC | 13.31 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ZFYVE27-201 | ENST00000337540 | 2927 nt | TSL 2 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KLHL12-203 | ENST00000367261 | 3359 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VANGL1-201 | ENST00000310260 | 2265 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PMEL-218 | ENST00000552882 | 2516 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GPR12-202 | ENST00000405846 | 4850 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PER3-209 | ENST00000614998 | 6261 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TKT-203 | ENST00000423525 | 2831 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RETREG3-201 | ENST00000309428 | 3759 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SDHD-201 | ENST00000375549 | 1439 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMC5-204 | ENST00000541464 | 3581 nt | TSL 2 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COL1A1-201 | ENST00000225964 | 6727 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHGB1-201 | ENST00000523390 | 4590 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ADGRE2-205 | ENST00000594076 | 2193 nt | TSL 5 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SLC8B1-213 | ENST00000552014 | 3289 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SGCA-202 | ENST00000344627 | 1057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SFT2D2-202 | ENST00000367829 | 491 nt | TSL 5 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TISP43-202 | ENST00000409982 | 1039 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL358215.1-201 | ENST00000481350 | 482 nt | TSL 5 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NDUFA3-214 | ENST00000485876 | 963 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC253536.5-201 | ENST00000506097 | 347 nt | BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC024405.2-201 | ENST00000528459 | 810 nt | TSL 5 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | KRT17P4-203 | ENST00000579355 | 621 nt | TSL 3 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC121320.1-201 | ENST00000580975 | 839 nt | TSL 3 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AP002414.5-201 | ENST00000591853 | 258 nt | TSL 4 BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PTPN20CP-201 | ENST00000614090 | 920 nt | BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC134878.2-201 | ENST00000620700 | 1265 nt | BASIC | 13.3 | □□□□□ -0.28 | | |