Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYV3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYV3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYV3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V9GYV3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms