Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN6Q9Y6Q1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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