Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms