Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3EQ9NVU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3EQ9NVU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms