Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNPOQ9NVS9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PNPOQ9NVS9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms