Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTLC3Q9NUV7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms