Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCSER1Q9C0I3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms