Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFJQ9BTM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFJQ9BTM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms